医院办公系统，经历了非常简单的单机公文处置和档案管理的初始阶段，然后发展到基于局域网的第二代办公系统，虽然拓展了一些功能，但主要核心功能依然正处于公文的公布、管理和文档留存；20世纪90年代末，随着信息技术的发展，演进到新一代的OA系统，着眼与横跨科室跨部门的协同办公，同时拓展出有更加多的功能，还包括即时通讯、网络会议、在线调查和培训等。面临高度信息化和网络化，医院办公于是以逐步南北与无纸和流程自动化阶段，反对移动办公，病以全面实现文件管理制度化、标准化、规范化和网络化为目标，反映协同办公的理念。目前各大医院的信息化建设如火如茶，但主要集中于在牵涉到门急诊、住院、影像、检验，手术等与病人信息息息相关的医疗领域，而办公管理自动化却更容易被医院的信息化建设所忽略。

2005年，中国医院协会医院管理专业委员会所482所医院展开调查，OA上线率为38.79%；而2007年卫生部统计资料信息中心对全国3765家医院调查，仅有567家医院（15.06%）正在用于OA作为办公管理的工具。而医院管理水准和效率的迟缓，即使在医疗信息化水准很高的前提下，医院的综合竞争力也不会大打折扣。

目前，由于医院管理人员对自动化办公的人事和解读的不完全，使得我管各地区医院办公系统的应用于程度差异大，发展不均衡，且应用于效果不理想。医院里，拿着各种纸张四处去找领导签署的现象也是常有的，所谓的办公自动化没将医务人员从荒谬的办公事务中解放出来。相比之下，医院管理的信息化建设相比之下领先于医院的医疗信息化建设。

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